在新的一季中主人公们依然到世界各地执行秘密任务，而他们的妻子则在后方默默的守候支持他们，并为丈夫保守秘密。他们的冒险依然在继续，此次当秘密行动组前往巴基斯坦执行任务时，一个主要成员留了下来，他打算

　　秘密行动组第三季开始，Jonas在逃往巴拿马时被政府刺客盯梢。在华盛顿，Col.Ryan尝试去搞清楚谁是试图拆散秘密行动组的幕后黑手，想要了解接近真相的答案。在回基地时，Tiffy去监狱看望悲惨的