电影讲述了集人间怨气的魔头妖祖即将现世，为了打败他拯救苍生，东方陌（林禹饰）、谛听（易正福饰）和功德掌门（九孔饰）三人四处寻找身为神猴的化身——孙小天（谢苗饰）。与此同时，妖祖觊觎封印在神猴体内的

混沌初开之时，世上的第一只妖降世，名元蒂，被奉为妖祖。千百万年后，昔日妖王孙悟空被唐僧从五行山下救出，孙悟空答应保护唐僧，前往西天取经。而传说中的妖祖元蒂再次现世，三界岌岌可危。两代妖王注定终极一战，但这次，孙悟空遇上了真正的劲敌。

五年前，一种西方病毒席卷中原，感染者嗜血滥杀，被称为“血妖eee。世人都知道是欧阳淳用祖传神兵长情剑斩杀病毒源头“妖祖”，但不知，那一战中他的爱人——岳清音的姐姐佩如感染了病毒成为了力量极强的新“妖祖